Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D454 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D454 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D454 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D454 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D454 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D454 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D454 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D454 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D454 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D454 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D454 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D454 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D454 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms