Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms