Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933436I01RikQ9D3T1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933436I01RikQ9D3T1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms