Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms