Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
D930007J09RikQ9D2K6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D930007J09RikQ9D2K6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms