Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc8Q9D2H8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Fndc8Q9D2H8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc8Q9D2H8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms