Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef12Q9D2F1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms