Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trappc6bQ9D289 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trappc6bQ9D289 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trappc6bQ9D289 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc6bQ9D289 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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