Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H0

Rita1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rita1Q9D1H0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rita1Q9D1H0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rita1Q9D1H0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rita1Q9D1H0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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