Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms