Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cysrt1Q9D1E4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cysrt1Q9D1E4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cysrt1Q9D1E4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cysrt1Q9D1E4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cysrt1Q9D1E4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms