Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc167Q9D162 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc167Q9D162 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms