Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms