Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed3Q9D0L1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms