Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0K1

Pex13, Peroxisomal membrane protein PEX13, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex13Q9D0K1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex13Q9D0K1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms