Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pbdc1Q9D0B6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pbdc1Q9D0B6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms