Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc47Q9D024 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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