Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsl3Q9CZW4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms