Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms