Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms