Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nde1Q9CZA6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms