Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klhl35Q9CZ49 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms