Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrs1Q9CYH6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrs1Q9CYH6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms