Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Bud23Q9CY21 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Bud23Q9CY21 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Bud23Q9CY21 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Bud23Q9CY21 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Bud23Q9CY21 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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