Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nip7Q9CXK8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nip7Q9CXK8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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