Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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