Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms