Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd8Q9CX56 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms