Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Yif1bQ9CX30 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Yif1bQ9CX30 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms