Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms