Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pin4Q9CWW6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms