Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm26657Q9CVR1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm26657Q9CVR1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms