Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sppl3Q9CUS9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sppl3Q9CUS9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms