Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms