Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud1Q9CUB6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms