Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pard3bQ9CSB4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pard3bQ9CSB4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms