Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931417E11RikQ9CR05 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms