Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PsenenQ9CQR7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PsenenQ9CQR7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PsenenQ9CQR7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PsenenQ9CQR7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PsenenQ9CQR7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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