Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mrpl35Q9CQL6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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