Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd1Q9CQK7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms