Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms