Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQF4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms