Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudt21Q9CQF3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms