Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atp6v0e1Q9CQD8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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