Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rpl39lQ9CQD0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rpl39lQ9CQD0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rpl39lQ9CQD0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rpl39lQ9CQD0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rpl39lQ9CQD0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rpl39lQ9CQD0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rpl39lQ9CQD0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl39lQ9CQD0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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