Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med4Q9CQA5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms