Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpa3Q9CQ71 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms