Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd4Q9CQ02 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms