Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms