Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl17Q9CPR4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms